国产精品久久白浆一区二区,精品人妻一区二区三区五十路,人无码Aⅴ片在线观看,欧美日韩亚洲在线电影

技術(shù)文章

TECHNICAL ARTICLES

當前位置:首頁技術(shù)文章晶體日記 (十五)- 真實的數(shù)據(jù)質(zhì)量(2)

晶體日記 (十五)- 真實的數(shù)據(jù)質(zhì)量(2)

更新時間:2024-08-14點擊次數(shù):702

評判數(shù)據(jù)標準的指標

也許是歷史傳統(tǒng)的問題, Rint (Rsym,Rmerge)被選中了作為評判數(shù)據(jù)標準的指標。甚至在很多不是很專業(yè)的書里,學生們都被告知Rint 需要低于多少,I/σ高于多少才能表示數(shù)據(jù)可用。于是乎,這些數(shù)值變成了評判數(shù)據(jù)質(zhì)量所謂的金標準??墒钱斕釂朢int 是什么意義時,跟什么因素相關(guān)時,大多數(shù)同學卻卡在了那里??赡躌int在大多數(shù)同學眼里就是個發(fā)表文章的門檻數(shù)值,具體是什么意義已經(jīng)不再重要。不然就不會有那么多同學追問著怎么把Rint修下去,或者解決掉所謂的“錯誤"。

誠然Rint本身的意義并不復雜。它的公式也看起來一目了然,表示著合并等效衍射點之間的誤差。Rint值越低,通常表示著數(shù)據(jù)的精度越高。然而這是有一定的前提條件的。Rint實際上并不是一個很好的評判數(shù)據(jù)質(zhì)量的指標。畢竟絕大多數(shù)數(shù)據(jù)都是通過Scale校正獲得。過度的Fitting,以及刻意排除太多的衍射點都可以獲得人為的更低的Rint(以及更高的I/σ)。而這些刻意追求的數(shù)字對結(jié)構(gòu)精修并無意義,反而會導致精修的結(jié)果失真。甚至一些數(shù)據(jù)處理的軟件會去迎合同學們的這種“追求",去“美顏"數(shù)據(jù),讓大家“喜聞樂見",然而有時掉進了坑里,卻渾然不知。Rint同時也受到數(shù)據(jù)收集的多重度的影響。過低的多重度,會讓衍射點沒有其它等效點可以進行比較,自然Rint就會很低,甚至接近于0,然而卻毫無意義(結(jié)構(gòu)甚至都無法解析)。而高多重度的數(shù)據(jù),由公式?jīng)Q定了Rint自然會升高,反而成了大家不喜歡看到的數(shù)值。但是不管怎么解釋,很多同學仍然不以為然,原因只是Checkcif不檢查多重度,但是對Rint卻有“嚴格"的門檻(而實際上大多數(shù)Rint高的問題是分辨率的問題)。同樣的I/σ也是一樣,不同的誤差模型的算法,自然得到的數(shù)值會大有不同。調(diào)高I/σ自然也是大家喜聞樂見的事情,比如故意降低σ,刪除更多的衍射點也會讓I/σ看起來更高。然而這些美顏的數(shù)據(jù),對結(jié)構(gòu)精修卻毫無意義。

對于多重度對Rint的影響,Rmeas解決了這個問題,所以對于蛋白晶體學傾向于用Rmeas。此外現(xiàn)在還有CC1/2 來表征數(shù)據(jù)質(zhì)量。不過在化學晶體學界似乎對這兩個數(shù)值并不感冒。也許是通常衍射太強,不需要更寬松的指標。這些指標在APEX4里都能輕松看到。
實例分析

比如前兩天講座的時候提到的一個數(shù)據(jù),大家投票的結(jié)果在意料之中。超過一半的同學都認為質(zhì)量更高的數(shù)據(jù)是A。如果這是不同的數(shù)據(jù)還情有可原,然而這是同一套數(shù)據(jù),同樣的結(jié)構(gòu)模型?;蛟S是顏色的誤導,讓同學們失去了基本的判斷力。A為什么會看起來更好看,因為Reject了很多數(shù)據(jù)。完整度表觀上只下降了2%,而實際上卻高達30%的數(shù)據(jù)被reject,Multiplicity極大的下降。保留下來的衍射點自然站在了一邊,雖然看起來更精確,卻丟失了準確。自然結(jié)構(gòu)精修的結(jié)果就會反過來打臉。追求某些數(shù)字,對結(jié)構(gòu)解析和精修本身毫無意義。結(jié)構(gòu)精修的質(zhì)量作為評判數(shù)據(jù)質(zhì)量的指標才更加合理。比如R1,健長的精度,殘余的電子峰等。

▲圖1  Better Data Quality A or B?

除了軟件處理造成的假象,有時候會遇到一些看起來數(shù)值質(zhì)量很高,卻怎么也精修不好的數(shù)據(jù)。比如有嚴重的無序,莫名的Q峰。這時候?qū)W⒂诮Y(jié)構(gòu)精修,會百思不得其解。從衍射圖上才會發(fā)現(xiàn)更多的端倪。孿晶自然不需要多做解釋,而另外一些問題則更加的隱蔽,單純從hkl上其實發(fā)覺不了任何問題。因為單晶的數(shù)據(jù)還原并不是還原的所有的信息,而是通過晶胞截選而來。而很多時候,“晶胞"不能反映衍射的全部信息,自然會丟掉很多原本的衍射細節(jié)。比如很多Smear的信號,Modulation的信號,衍射點形狀的信號。這些信息都不會在hkl文件中體現(xiàn)。普通的結(jié)構(gòu)精修自然也無法全部的反映晶體的實際狀況。

▲圖2 丟失的衍射信息 A,衍射點間的彌散信號 B,衍射的背景彌散,C,Modulation (Precession Image)

結(jié)論

所以數(shù)據(jù)質(zhì)量的評估,從來都不是單個指標,固定的標準。從衍射圖到數(shù)據(jù)處理,到結(jié)構(gòu)精修,每一步的細節(jié)都在告訴著我們的數(shù)據(jù)可能出現(xiàn)的問題。真實的數(shù)據(jù)才會有真實的結(jié)構(gòu),刻意為了迎合某些死板的標準,不惜去“美顏"甚至偽造數(shù)據(jù),也就背離了科學研究。

-轉(zhuǎn)載于《布魯克X射線部門》公眾號


掃一掃,關(guān)注公眾號

服務(wù)電話:

021-34685181 上海市松江區(qū)千帆路288弄G60科創(chuàng)云廊3號樓602室 wei.zhu@shuyunsh.com
Copyright © 2025束蘊儀器(上海)有限公司 All Rights Reserved  備案號:滬ICP備17028678號-2
国产福利一区二区写真-久久国产电影在线观看-亚洲国产一区二区三区亚瑟-中文字幕乱码亚洲无线码二区| 尤物视频在线观看网址-欧美午夜精品久久福利-久久这里只有精品视频5-国产精品成人综合色区| 尤物视频在线免费观看-粗大挺进孕妇人妻在线-国产精品自偷自拍对白-久久性生活免费看视频| 亚洲少妇熟女一区二区三区-熟女熟妇少妇妇女乱熟-一区二区三区不卡国产视频-成人精品一区二区三区综合| 欧美国产日本韩国一区二区-麻豆天美东精91厂制片-亚洲成人自拍视频在线观看-娇妻互换享受高潮91九色| 色偷偷东京热男人天堂-国产视频久久这里只有精品-美女视频中文字幕人妻-国产一区二区三区在线观| 尤物视频在线观看精品-日韩午夜男女爽爽影院-日本少妇下面好紧水多影片-国产亚洲精品视频在线网| 国产韩国精品一区二区三区-久久精品人妻一区二区三区av-黄片视频在线观看欧美-国产成人自拍在线视频| 午夜性色福利在线视频福利-久久精品视频免费获取地址-亚洲一区二区三区在线观看不卡-无套进入美女免费观看视频| 国产精品国产一区日韩一区-老色99久久九九爱精品-国产亚洲精品福利一区-亚洲av乱码av一区二区三区| 91福利精品第一导航-国产一区二区三区不卡精品-偷拍日本美女公厕尿尿-国产黄三级三级三级看三级| 国产精品亚洲精品日韩精品-狠狠爱婷婷网五月天久久-国产精品激情成色在人-国产农村妇女精品三级一区二区| 少妇人妻午夜精品视频-亚洲乱妇老熟女爽到潮的片-最新国产黄色一区二区-亚洲一区国产精品喷潮| 少妇高潮真爽在线观看-韩国福利视频一区二区三区-警花av一区二区三区-尤物视频国产在线观看| 国产福利亚洲精品精彩在线-日韩在线精品视频免费-亚洲成人国产精品av-日本不卡一区二区三区四区视频| 国产精品剧情一区在线观看-精品伊人久久大香线蕉-一起草视频在线播放观看-精品少妇人妻av一区二区蜜桃| 未满十八禁止免费观看网站-国产夫妻福利在线观看-亚洲国产黄色精品在线-日韩亚洲一卡二卡三卡| 熟女人妻中文字幕在线视频-91久久成人精品探花-国产精品黄色一区二区三区-99精品国产99久久久久97| 国产精彩自拍视频在线-岛国视频免费在线播放-91久久精品国产综合另类专区-午夜福利欧美激情福利| 亚洲a级一区二区三区-人妻中文字幕精品在线-日韩精品中文字幕人妻系列-香蕉久久最新精品视频| 久久噜噜噜精品国产亚洲综合-91精品国产高清久久福利-精品国产一区二区三区麻豆-日本加勒比一区二区在线观看免费| 免费人成视频在线观看播放网站-日韩精品久久精品三级-91精品一区二区三区久久蜜桃-中文字幕av久久激情亚洲精品| 日韩精品视频网在线播放-亚洲综合网一区二区三区偷拍-岛国av在线播放观看-欧美日韩国产另类综合| 国产精品自在线拍国产-久久精品韩国日韩精品-久久夜色国产精品亚洲av蜜桃-日韩精品一区二区三区四区免费| 一本久道视频无线视频试看-亚洲国产精品一区二区三区久久-中文字幕色偷偷人妻久久-久久精品99国产精品中| 91精品久久综合熟女-日产精品毛片av一区二区三区-国产精品永久在线播放-一区二区中文字幕在线视频| 大屁股丰满肥臀国产在线-亚洲国产一区二区精品在线观看-久久黄色精品内射胖女人-日韩精品国产综合一区二区| 亚洲老妈激情一区二区三区-夜晚福利视频亚洲精品自拍视频-亚洲av永久精品一区二区在线-中文国产人精品久久蜜桃| 岳的大肥屁熟妇五十路99-偷拍美女解手视频精品-日韩欧美一区二区三区精品-亚洲国产精品成人自拍| 国产精品精品久久99-久久羞羞色院精品全部免费-日韩中文粉嫩一区二区三区-外国黄色三级视频网站| 在线三级电影在线观看-在线成人激情自拍视频-日本在线视频播放91-国产精品一区二区男女羞羞无遮挡| 亚洲熟妇激情视频99-丝袜美腿诱惑av网站在线观看-欧美国产综合激情一区精品-激情综合网激情五月我去也| 欧美日韩在线有码中文-亚洲美女一区二区暴力深喉吞精-亚洲av日韩一区二区三区-国产激情视频在线观看播放| 日韩精品中文字幕人妻一区-国产免费午夜福利一区二区-亚洲国产精品久久亚洲精品-亚洲伦理一区二区三区中文| 久久国产精品白丝美女-日韩伦理视频在线观看-蜜桃传媒在线免费入口-国产精品一区二区不卡视频| 午夜性福福利视频一区二区三区-午夜福利在线看片在线-欧洲内射免费人文艺术-亚洲天堂成人av在线| 亚洲成人av综合在线-日韩精品久久久中文字幕人妻-国产精品无套白嫩剧情-五月婷婷久久激情综合| 青青草原av青青草原-美日韩精品一区二区三区-中文字幕日本乱码在线-久久热久久热在线视频| av成人在线免费观看-亚洲av黄片免费观看-亚洲综合精品天堂夜夜-久久国产精品久久国产精品| 日本黄网站三级三级三级-91网址免费在线观看-肥老熟女性强欲五十路-无套内谢少妇高朝毛片| 福利午夜视频在线观看-亚洲国产精品久久av麻豆-人妻被中出忍不住呻吟-国产极品尤物在线精品福利一区|